Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB1P23443 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms