Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms