Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BGNP21810 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BGNP21810 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms