Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1P21675 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1P21675 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms