Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms