Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms