Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODC1P11926 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODC1P11926 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODC1P11926 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms