Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms