Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARBP10826 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARBP10826 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARBP10826 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARBP10826 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms