Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms