Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POP4O95707 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POP4O95707 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms