Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms