Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DFNA5O60443 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms