Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCO2O43819 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms