Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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