Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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