Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBDO15205 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms