Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1428.3 ms