Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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