Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms