Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms