Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms