Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms