Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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