Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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