Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms