Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms