Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms