Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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