Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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RDH8Q9NYR8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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