Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms