Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCIQ9NVI1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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