Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED17Q9NVC6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms