Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKKSQ9NPJ1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms