Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms