Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIF1Q9H611 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 427 ms