Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms