Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms