Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms