Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms