Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A23Q9BV35 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms