Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms