Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms