Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPR78Q96P69 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms