Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms