Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC114Q96M63 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms