Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCARF2Q96GP6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCARF2Q96GP6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms