Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms