Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms