Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTV1Q96GA3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms